La valorisation de la Recherche


Publications Communications Colloques Mémoires

Communications

Christian MOUGIN, Karine LAVAL, Marc LEGRAS, Sylvie BARRAY, Salima TAIBI, Daniel TESSIER, "Chemical contamination versus non chemical stressors: the case study of agricultural soils.", SETAC Europe 17th Annual Meeting, Porto, Portugal, 20-24 May 2007, Résumé de la communication

Karine LAVAL, Christian MOUGIN, Patrice LEPELLETIER, Sylvie BARRAY, Daniel TESSIER, "Elaboration et validation d’un indice d’état biologique des sols.", 9ème JNES, Journées Nationales d'Etude des Sols, Angers, INH, 3-5 avril 2007, Résumé de la communication

Sylvie DESAIRE, Odile LUCAS, Samia TIRECHE, Karine LAVAL, "Développement d’une nouvelle approche pour la quantification des bactéries telluriques : La cytométrie en flux.", 9ème JNES, Journées Nationales d'Etude des Sols, Angers, INH, 3-5 avril 2007, Résumé, Poster

Isabelle GATTIN, Marthe AKPA-VINCESLAS, Caroline BAILLEUL, Christian MOUGIN, Karine LAVAL, "Activités enzymatiques et qualité des sols agricoles", 9ème JNES, Journées Nationales d'Etude des Sols, Angers, INH, 3-5 avril 2007, Résumé, Poster

Marc LEGRAS, Christophe GANGNEUX, Caroline BAILLEUL, Jeanne Chantal DUR, Patrice LEPELLETIER, Christian MOUGIN, Karine LAVAL, "La biomasse fongique des sols agricoles. Influence des caractéristiques physicochimiques des sols et conséquences d'une pollution cuivrique.", 9ème JNES, Journées Nationales d'Etude des Sols, Angers, INH, 3-5 avril 2007, Résumé, Poster

Pierre PLASSART, Karine LAVAL, Sylvie BARRAY, "Evolution de la structure des communautés bactériennes telluriques : impact du Cuivre.", 9ème JNES, Journées Nationales d'Etude des Sols, Angers, INH, 3-5 avril 2007, Résumé de la communication

Marc LEGRAS, Caroline BAILLEUL, Daniel TESSIER, Jeanne Chantal DUR, Christophe GANGNEUX, Salima TAIBI, Karine LAVAL, "Effect of physicochemical characteristics of agricultural soils on fungal biomass. Impact of copper", EMEC 7, European Meeting on Environmental Chemistry, Brno, République Tchèque, 6-10 december 2006, Résumé, Poster

Sylvie BARRAY, Karine LAVAL, Marc LEGRAS, Christian MOUGIN, Salima TAIBI et Daniel TESSIER, "Elaboration et validation d’un indice d’état biologique des sols", 3ème Séminaire d'Ecotoxicologie de l'INRA, Dinard (France), 17-20 Septembre 2006, Résumé sur demande

Hélène SAUVAGE, Karine LAVAL, Frédéric BOIS, Sylvie BARRAY, "Development of a detection and quantification method of aphanomyces euteiches french isolates in soil.", ISME-11, 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna (Autriche), 20-25 august 2006, Résumé, Poster

Raphael CALBRIX, Karine LAVAL, Olivier CHABRERIE, Laetitia FOURRIE and Sylvie BARRAY, "Impact of organic amendments on the dynamics of soil microbial biomass and bacterial communities in agricultural practice", ISME-11, 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna (Autriche), 20-25 august 2006, Résumé, Poster

Pierre PLASSART, Sylvie DESAIRE, Christophe GANGNEUX, Anne Sophie LEMAIRE, Karine LAVAL and Sylvie BARRAY, "Spatiotemporal evolution of bacterial community structure in agricultural soils", ISME-11, 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna (Autriche), 20-25 august 2006, Résumé, Poster

Marc LEGRAS, Christophe GANGNEUX, Daniel TESSIER, Jeanne-Chantal DUR, Caroline BAILLEUL, Salima TAIBI and Karine LAVAL, "Effect of physicochemical characteristics of agricultural soils on fungal biomass", ISME-11, 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna (Autriche), 20-25 august 2006, Poster

Mickael HEDDE, Thibault DECAËNS, Héléne SAUVAGE, Marthe AKPA et Fabrice BUREAU, "Relations entre diversité des lombriciens, stockage du C organique et structuration des sols de prairies temporaires", VIIIème Journées d'Ecologie Fonctionnelle (JEF), Nouan-le-Fuzelier (France), 6-9 mars 2006, Communication sur demande

Raphael CALBRIX, Karine LAVAL et Sylvie BARRAY, "Impact des intrants organiques et des conduites culturales sur la biomasse microbienne et la diversité des bactéries telluriques", Séminaire SCALE, Mont-Saint-Aignan, 26 janvier 2006, Communication sur demande

Héléne SAUVAGE, Karine LAVAL, Frédéric BOIS et Sylvie BARRAY, "Détection et quantification d'aphanomyces euteiches par PCR quantitative dans les parcelles de pois protéagineux", Journées Jean Chevaugeons, VI Rencontres de phytopathologie/mycologie de la Société Francaise de Phytopathologie, Aussois (France), 15-19 janvier 2006, Résumé, Poster sur demande

Maud MAZE, Caroline BAILLEUL, Jeanne-Chantal DUR, Daniel TESSIER, Karine LAVAL and Marc LEGRAS, "Effect of physico-chemical characteristics of agricultural soils on fungal biomass – Case of meadow and crop", European Meeting on Environmental Chemistry, EMEC 6, Belgrade, Serbia & Montenegro, 6-11 december 2005, Résumé, Poster sur demande

Christian MOUGIN, Karine LAVAL, Salima TAIBI, Daniel TESSIER, Anne Sophie LEMAIRE and Sylvie BARRAY, "Towards an index of biological state of the soil as a new tool for ecotoxicological studies", SETAC Europe 15th Annual Meeting, Lille, 22-26 may 2005, Résumé de la communication, Dia. sur demande

Marc LEGRAS, Quentin BURY, Caroline BAILLEUL, Frédéric GIRO, Marie-Laure FOLLET-GUEYE and Azeddine DRIOUICH, "Soil to Flax Trace Element Transfer from Different Contaminated Soils: A Three Year Study in Real Conditions", 8th International Conference on the Biogeochemistry of Trace Elements, ICOBTE, Adelaïde, Australie, 3-7 april 2005, Résumé, Poster sur demande

Hélène SAUVAGE, Karine LAVAL, Frédéric BOIS et Sylvie BARRAY, "Mise au point d’une méthode de détection et de quantification d’Aphanomyces euteiches par PCR quantitative dans les sols agricoles", Journées "mycologie" de la SFM, Marseille, 2-4 février 2005, Résumé, Poster sur demande

Marc LEGRAS, Caroline BAILLEUL and Marthe AKPA-VINCESLAS, "Une méthode rapide et sensible pour quantifier la biomasse fongiques dans les sols agricoles", JNES 2004, AFES, Bordeaux, France, 26-28 Octobre 2004, Résumé, Poster sur demande.

Claire CHENU, Yves LE BISSONNAIS, Diego COSENTINO, Karine LAVAL, Sabine HOUOT, Philippe SAULAS et May BALABANE, "Evolution de la stabilité structurale et des fractions labiles des matières organiques dans un sol limoneux sous l’effet de systèmes de culture alternatifs", JNES 2004, AFES, Bordeaux, France, 26-28 Octobre 2004, Résumé sur demande.

Caroline BAILLEUL, Isabelle GATTIN-TRINSOUTROT, Bernard NICOLARDOT, Lars STOUMAN JENSEN, "Qualité biochimique des résidus végétaux, de nouvelles approches de caractérisation ", 6ème Colloque sur "Rôle et fonction des matières organiques dans l'environnement" , Groupe Français de l’IHSS, Reims, France, 13-15 Octobre 2004, Résumé, Poster sur demande.

Raphaël CALBRIX, Karine LAVAL and Sylvie BARRAY, "Effect of organic fertilizers on genetic and functional diversity of soil micro-organisms", EUROSOIL 2004, Freiburg, Germany, 4th-12th September 2004, Résumé, Poster sur demande.

Marthe AKPA-VINCESLAS, Christophe GANGNEUX, Barbara PAWLAK, Raphaël CALBRIX, Sylvie BARRAY and Karine LAVAL, "Impacts of meadows restoration on telluric microbial diversity", EUROSOIL 2004, Freiburg, Germany, 4th-12th September 2004, Résumé, Poster sur demande.

Marc LEGRAS, Caroline BAILLEUL and Marthe AKPA-VINCESLAS, "A fast and sensitive method to determine the fungal biomass in the agricultural soils", EUROSOIL 2004, Freiburg, Germany, 4th-12th September 2004, Résumé, Poster sur demande.

Christophe GANGNEUX, Elena MARQUES, Pierre PLASSART and Karine LAVAL, "Real-time PCR to investigate telluric fungi", EUROSOIL 2004, Freiburg, Germany, 4th-12th September 2004, Résumé, Poster sur demande.

Quentin BURY, Frédéric GIRO and Marc LEGRAS, "Trace elements speciation in soils, phytoavailability and distribution in field-grown flax oilseeds as affected by different contaminated soils", 9th FECS Conference on Chemistry and the Environment, 2nd SFC meeting on Environmental Chemistry, Bordeaux, France, 29th August - 1st September 2004, Résumé de la communication.

Isabelle GATTIN-TRINSOUTROT, Caroline BAILLEUL, Bernard NICOLARDOT and L.S. JENSEN, "A new approach to evaluate crop residues biochemical quality - Interest for modelling C and N fluxes in soil", ESA 2004, Copenhague, Denmark, July 12-15 2004, Résumé de la communication.

Raphaël CALBRIX, Laetitia FOURRIE, Karine LAVAL et Sylvie BARRAY, "Etude de l'incidence des épandages de matières organiques sur les communautés microbiennes telluriques par différentes méthodes", Journées Techniques ADEME "Retour au sol des Matières Organiques, Paris, 27 et 28 avril 2004, Article de la communication.

Hélène SAUVAGE, Christophe GANGNEUX, Barbara PAWLAK, Raphaël CALBRIX, Sylvie BARRAY and Karine LAVAL, "Impacts of meadows restoration on telluric microbial diversity", International Symposium on Structure and Function of Soil Microbiota, Marburg, Allemagne, September 18-20 2003, Résumé, Poster sur demande.

Raphaël CALBRIX, Karine LAVAL and Sylvie BARRAY, "Effect of organic fertilizers on genetic and functional diversity of soil micro-organisms", International Symposium on Structure and Function of Soil Microbiota, Marburg, Allemagne, September 18-20 2003, Résumé, Poster sur demande.

Marc LEGRAS, Marie-Laure FOLLET-GUEYE, Frédéric GIRO, Francois BERT, Jean-Marc LLORENS and Azeddine DRIOUICH, "Interdisciplinary Study of Trace-Elements Distribution and their Uptake by Flax Plants. Chemical Speciation in Agricultural Soil and Microscopical. Analysis of Plant Tissues", 7th International Conference on the Biogeochemistry of Trace Elements, ICOBTE, Uppsala, Suède, June 15-19 2003, Résumé, Poster sur demande.

Hélène SAUVAGE, Raphaël CALBRIX, Barbara PAWLAK, Christophe GANGNEUX, Sylvie BARRAY et Karine LAVAL, "La restauration des prairies : impact sur la diversité microbienne tellurique", Colloque d’Ecologie Microbienne, CEM03, Carry-le-Rouet, France, 25-28 mai 2003, Résumé, Poster sur demande.

Raphael CALBRIX, Karine LAVAL et Sylvie BARRAY, "Impacts des apports organiques sur les communautés microbiennes telluriques", Colloque d’Ecologie Microbienne, CEM03, Carry-le-Rouet, France, 25-28 mai 2003, Résumé, Poster sur demande.

Marc LEGRAS, Fatima KHARBOUCH, Frédéric GIRO, François BERT and Jean-Marc LLORENS, "Contaminated agricultural soil: Trace-elements speciation, their phytoavailability and their uptake by flax plants", 12th International Conference on Heavy Metals in the Environment, ICHMET, Grenoble, France, 26-30 May 2003, Résumé de la communication.

Raphael CALBRIX, Karine LAVAL and Sylvie BARRAY, "Effect of organic fertilizers on genetic and functional diversity of soil microorganisms", 225th ACS National Meeting, New Orleans, LA, USA, 23-27 March 2003, Résumé, Poster sur demande.

Hélène SAUVAGE, Raphael CALBRIX, Christophe GANGNEUX, Barbara PAWLAK, Marthe AKPA-VINCESLAS and Karine LAVAL, "Effect of grassland restoration on organic matter and microbial communities", 225th ACS National Meeting, New Orleans, LA, USA, 23-27 March 2003, Poster sur demande.

Marc LEGRAS, Fatima KHARBOUCH, Frédéric GIRO, François BERT, Marie-Laure FOLLET-GUEYE, Jean-Marc LLORENS and Azeddine DRIOUICH, "Trace-elements speciation in agricultural soil and microscopical analysis of plant tissues. Interdisciplinary study of trace-elements distribution and their uptake by flax plants", 3rd European Meeting on Environnemental Chemistry, EMEC3, Genève, Switzerland, 11-14 December 2002, Résumé, Poster sur demande.

Fatima KHARBOUCH, Jean-Marc LLORENS, Frédéric GIRO, François BERT, Marie-Laure FOLLET-GUEYE, Azeddine DRIOUICH and Marc LEGRAS, "Mise en place de techniques de spéciation des éléments traces dans les sols en vue d’établir une relation avec leur phytodisponibilité pour le lin oléagineux", Colloque SFC Environnement 2002, Paris, France, 14-15 November 2002, Résumé, Poster sur demande.

Marthe AKPA-VINCESLAS, Raphael CALBRIX, Hélène SAUVAGE, Christophe GANGNEUX et Karine LAVAL, "Impact de l'age du système prairial sur la dynamique des matières organiques et des communautés microbiennes telluriques", AFES 2002, 7èmes Journées Nationales de l'Etude des Sols, Orléans, France, 22-24 Octobre 2002, Poster sur demande.

Fabrice BUREAU, Marthe AKPA-VINCESLAS, Pascale PUGET, "Incidence des modes d'utilisation du sol sur les stocks d'éléments nutritifs (C, N et P) dans un méandre de la basse vallée de Seine", AFES 2002, 7èmes Journées Nationales de l'Etude des Sols, Orléans, France, 22-24 Octobre 2002, Résumé du poster.

Raphael CALBRIX, Karine LAVAL et Sylvie BARRAY, "Effet of organic fertilizers on soil microbial biomass", IUMS 2002, Xth International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, Paris, France, 27 July-1 August 2002, Résumé, Poster.

Michel METAYER, Marc LEGRAS, Olga GRIGORCHOUK, Victor NIKONENKO, Dominique LANGEVIN, Michel LABBE, Laurent LEBRUN and Victor SHAPOSHNIK, "Facilitated transport of alpha-alanine and phenylalanine through sulfonic cation-exchange membranes", International Congres on Membranes, ICOM 2002, Toulouse, France, 7-12 July 2002.

Marc LEGRAS, Yuichi HIRATA, Quang Trong NGUYEN, Dominique LANGEVIN and Michel METAYER, "Sorption and diffusion behaviors of water in Nafion 117 membranes with different counter ions", ICOM 2002, Toulouse, France, 7-12 July 2002, Résumé de la communication.

Raphael CALBRIX, Pascale PUGET, Hélène SAUVAGE, Emilie AUBERT et Karine LAVAL, "Grassland restoration: effets on organic matter and microbial communities", European Grassland Federation (EGF) 2002 Conference, La Rochelle, France, 27-30 May 2002, Résumé, Poster sur demande.

Olivier CHABRERIE, Karine LAVAL, Pascale PUGET, Hélène SAUVAGE, Sylvie DESAIRE et Didier ALARD, "Can we etablish a link between plant and soil microbial diversity? A case study in a chalk grassland in north-western France", European Grassland Federation (EGF) 2002 Conference, La Rochelle, France, 27-30 May 2002, Résumé, Poster sur demande.

Raphael CALBRIX, Pascale PUGET, Hélène SAUVAGE et Karine LAVAL, "Effet de l’inclusion de la prairie dans la rotation des cultures, sur la diversité des micro-organismes du sol", Rennes, France, 2002, Résumé, Poster sur demande.

Jean-Marc LLORENS, "La méthode de raisonnement de la fertilisation PK: un outil pour l'agriculture", COMIFER-GEMAS, 5ème Rencontres de la fertilisation raisonnée et de l'analyse de terre, Blois, France, 27-29 Novembre 2001, Article de la communication.

Marc LEGRAS, Pascale PUGET, Karine LAVAL, Elisabeth MOREAU et Jean-Marc LLORENS, "Apport de la Chimie dans l'Agriculture, pour la compréhension du fonctionnement des sols", SAJEC 2001, Rouen, France, 16-18 Octobre 2001, Résumé du poster.

Pascale PUGET, Laurie E. DRINKWATER & Rita KOCH, "Short-Term Carbon Dynamic of Maize Residue into an Organically and Conventionally-managed Agroecosystems", 11th Nitrogen Workshop, Reims, France, 9-12 September 2001, Résumé de la communication.

TRINSOUTROT I., JOCTEUR MONROZIER L. and NICOLARDOT B., "Contribution of several analytical tools, global methods and spectroscopy in biochemical quality of crop residues determination". 11th Nitrogen Workshop, Reims, France, 9-12 September 2001.

JENSEN L.S., STENBERG B., BRELAND T.A., HENRIKSEN T.M., PALMASON F., PEDERSEN A., SALO T., TRINSOUTROT I. and NICOLARDOT B., "Near Infra red spectroscopy (NIR) for characterisation of plant residues quality. A new approach for predicting decomposition and nitrogen release in agricultural soils", 11th Nitrogen Workshop, Reims, France, 9-12 September 2001.

Karine LAVAL, Pascale PUGET and Jean-Marc LLORENS, "Study of Microorganism Community of Runoff Waterland of Soil Aggregate Fractions by ARDRA 16S and 18S", Eurosoil 2000, British Society of Soil Science, University of Reading, Royaume-Uni, 4-6 September 2000.

Karine LAVAL et Sylvie BARRAY, "Différentes approches pour l'étude de la communauté microbienne des sols en fonction des modes d'occupation", "Fonctions de la biodiversité Microbienne: comprendre pour gérer", Réseau "Biodiversité et Ecologie Microbienne", Aussois III, Aussois, France, 2-5 Mai 2000. Résumé.

TRINSOUTROT I., RECOUS S., MARY B., JUSTES E. and NICOLARDOT B., "C and N mineralization of oilseed rape crop residues in soil", 10th International Rapeseed congress, Canberra, Australia, 26-29th September 1999.

NICOLARDOT B., TRINSOUTROT I., BENTZ B., RECOUS S. and MARY B., "Interest of the N content of crop residues as a predictor of N mineralization in soil". 10th Nitrogen workshop, The Royal Veterinary and Agricultural University, Copenhagen, Denmark, 23-26 August 1999.


Publications

SAUVAGE Hélène, "Prospectives en vue d’améliorer la détection de l’Aphanomyces", Perspective Agricole, 329 (2006), 23-21.

GANGNEUX Christophe, MERCIER Anne, AKPA-VINCESLAS Marthe, PLASSART Pierre, BARRAY Sylvie and LAVAL Karine, "Molecular and functional responses of soil microbial communities under grassland restoration", soumis.

SAUVAGE Hélène, MOUSSART Anne, BOIS Frédéric, TIVOLI Bernard, BARRAY Sylvie and LAVAL Karine, "Development of a molecular method to detect and quantify Aphanomyces euteiches in soil", soumis.

GANGNEUX Christophe, AKPA-VINCESLAS Marthe, SAUVAGE Hélène, DESAIRE Sylvie, Sabine HOUOT and LAVAL Karine, "Fungal bacterial and plant dsDNA contributions to soil total DNA extracted from agricultural silty soils: Relationships with chloroform labile carbon", soumis.

CALBRIX Raphael, BARRAY Sylvie, CHABRERIE Olivier, FOURRIE Laetitia and LAVAL Karine, "Impact of organic amendements on the dynamics of soil microbial biomass and bacterial communities in agricultural practice", Applied Soil ecology, (2006) accepté.

CALBRIX Raphael, LAVAL Karine and BARRAY Sylvie, "Analysis of the potential functional diversity of the bacterial community in soil: a reproductible procedure using sole-carbon-source utilization profiles", European journal of soil biology, 41 (2005) 11-20.

PETERSEN B.M., JENSEN L.S., HANSEN S., PEDERSEN A., HENRIKSEN T.M., SORENSEN P., TRINSOUTROT-GATTIN I. and BERNTSEN J. , "CN-SIM a model for the turnover of soil organic matter. II: Short-term carbon and nitrogen development", Soil biology and Biochemistry. Soil Biology & Biochemistry, 37 (2005) 375-393.

LERICHE Françoise, BORDESSOULES Amélie, FAYOLLE Karine, KAROUI Romdhane, LAVAL Karine, LEBLANC Ludovic and DUFOUR Eric , "Aleration of raw-milk cheese by Pseudomonas spp: Monotoring the sources of contamination using fluorescence spectroscopy and metabolic profiling", Journal of Microbiological Methods, 59 (2004) 33-41.

BODILIS Josselin, CALBRIX Raphaël, GUERILLON Josette, MERIEAU Annabelle, PAWLAK Barbara, ORANGE Nicole and BARRAY Sylvie , "Phylogenetic Relationships Between Environmental and Clinical Isolates of Pseudomonas fluorescens and Related Species Deduced from 16S rRNA Gene and OprF Protein Sequences", Systematic and Applied Microbiology, 27 (2004) 93-108.

GANGNEUX C., DAVEAU M., HIRON M., DERAMBURE C., PAPACONSTANTINOU J., SALIER J.P. , "The inflammation-induced down-regulation of plasma Fetuin-A (alpha2HS-Glycoprotein) in liver results from the loss of interaction between long C/EBP isoforms at two neighbouring binding sites", Nucleic Acids Res. 31, 20 (2003) 5957-5970.

LEGRAS M., KHARBOUCH F., GIRO F., BERT F. and LLORENS J.M., "Contaminated agricultural soil: Trace-elements speciation, their phytoavailability and their uptake by flax plants ", J. Phys. IV France, 107 (2003) 765-769.

CHABRERIE Olivier, LAVAL Karine, PUGET Pascale, DESAIRE Sylvie and ALARD Didier, "Relationship between plant and soil microbial communities along a successional gradient in a chalk grassland in north-western France"", Applied Soil Ecology, 24 (2003) 43-56.

CLAEYSSENS S., GANGNEUX C., BRASSE-LAGNEL C., RUMINY P., AKI T., LAVOINNE A., SALIER J.P., "Amino acid control of the human glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase gene transcription in hepatocyte", Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 285, 5 (2003) G840-849.

LEGRAS Marc, HIRATA Yuichi, NGUYEN Quang Trong, LANGEVIN Dominique and METAYER Michel , "Sorption and diffusion behaviors of water in Nafion 117 membranes with different counter ions", Desalination, 147 (2002) 351-357.

METAYER M., GRIGORCHUCK O.V., NIKONENKO V.V., LANGEVIN D., LEGRAS M., LEBRUN L., SHAPOSHNIK V.A., "Facilitated transport of non-electrolytes through ion-exchange membranes: Concentration polarization and rate-determining stage in a tubular membrane system ", Russian journal of electrochemistry, 38, 8 (2002) 873-883.

M. METAYER, M. LEGRAS, O. GRIGORCHOUK, V. NIKONENKO, D. LANGEVIN, M. LABBE, L. LEBRUN and V. SHAPOSHNIK, "Facilitated transport of a-alanine and phenylalanine through sulfonic cation-exchange membranes", Desalination, 147, 1-3 (2002) 375-380.

TRINSOUTROT I., JOCTEUR MONROZIER L., CELLIER J. and NICOLARDOT B., "Assessment of the biochemical composition of oilseed rape (Brassica napus L.) 13C-labelled residues by global methods, FTIR and 13C-NMR-CP/MAS", Plant and Soil, 234 (2001) 61-72.

PUGET, P, DRINKWATER, L.E., "Fate of carbon from a cover crop: distinction of aboveground vs. belowground origin", Soil Science Society of America Journal, 65 (2001) 771-779.

TRINSOUTROT I., NICOLARDOT B., JUSTES E. and RECOUS S., "Decomposition in the field of residues of oilseed rape grown at two levels of nitrogen fertilization. Effects on the dynamics of soil inorganic nitrogen between successive crops" Nutrient cycling in agro-ecosystems, 56 (2000) 125-137.

RUMINY P., GANGNEUX C., CLAEYSSENS S., SCOTTE M., DAVEAU M., SALIER J.P., "Gene transcription in hepatocytes during the acute phase of a systemic inflammation: from transcription factors to target genes", Inflamm. Res., 50, 8 (2001) 383-390. Review.

TRINSOUTROT I., RECOUS S., BENTZ B., LINERES M., CHENEBY D. and NICOLARDOT B., "Biochemical quality of crop residues and C and N mineralization kinetics under non-limiting N conditions", Soil Science Society of American Journal, 64 (2000) 918-926.

TRINSOUTROT I., RECOUS S., MARY B. and NICOLARDOT B., "C and N fluxes of decomposing 13C and 15N Brassica napus L.: effects of residue composition and N content", Soil Biology and Biochemistry, 32 (2000) 1717-1730.

BANINE F., GANGNEUX C., MERCIER L., LE CAM A., SALIER J.P., " Positive and negative elements modulate the promoter of the human liver-specific alpha2-HS-glycoprotein gene", Eur. J. Biochem. 267, 4 (2000) 1214-1222.

DEJOUX J. F., RECOUS S., MEYNARD J. M., TRINSOUTROT I. and LETERME Ph., " Fate of nitrogen from winter frozen rapeseed leaves : mineralization fluxes to environment and uptake by rapeseed crop in spring", Plant and soil, 218 (2000) 257-272.

LETOUVET-PAWLAK B., BARRAY S., LAVAL-FAVRE K, GUESPIN-MICHEL J. F., " Kinetics of secretion of recombinant acid phosphatase by Myxococcus xanthus : a sensitive probe for the assay of protein translocation through the envelopes", Journal of General Microbiology , 139 (1998) 3243-3252.

BANINE F., GANGNEUX C., LEBRETON J.P., FREBOURG T., SALIER J.P., " Structural and functional analysis of the 5'-transcription control region for the human alpha2-HS glycoprotein gene", Biochim. Biophys. Acta. 1398, 1 (1998) 1-8.

Philippot L., Clays-Josserand A., Lensi R., Trinsoutrot I., Normand Ph. and Potier P. , " Purification of the dissimilative nitrate reductase of Pseudomonas fluorescens and the cloning and sequencing of its corresponding genes", Biochimica Biophysica Acta, 1350 (1997) 272-276.

LAVAL-FAVRE K., LETOUVET-PAWLAK B., FRIEDRICH T., ALEXANDRE J. & GUESPIN-MICHEL J. F., "A gene involved in both protein secretion during growth and starvation induced development encodes a subunit of the NADH- ubiquinone oxydoreductase in Myxococcus xanthus", Molecular Microbiology, 23 (1997) 1043-1052.

LAVAL-FAVRE K., LETOUVET-PAWLAK B., BARRAY S. & GUESPIN-MICHEL J. F., "Starvation yields a drastic decrease in outer membrane permeability to a periplasmic foreign protein in Myxococcus xanthus", Microbiology, 141 (1995) 3119-3126.


Mémoires

Samia TIRECHE, "Etude de l'impact du cuivre sur les communautés bactériennes telluriques par une approche novatrice: la cytométrie en flux", Rapport Bibliographique, Master 1 Pro Biologie cellulaire et toxicologie, Université du Havre, Bibliothèque Esitpa, 2006. SD, KL

Louise COMMARE, "Caractérisation de matières organiques exogènes valorisées en agriculture", Rapport Bibliographique, Master 1 Pro Biologie Fondamentale et Appliquée, Université du Havre, Bibliothèque Esitpa, 2006. CB, IG

Boniface HARELIMANA, "Les activités enzymatiques comme bioindicateurs de la pollution des sols par le cuivre", Rapport Bibliographique, Master Pro Evaluation des risques environnementaux - Risques Chimiques, Université du Havre, Bibliothèque Esitpa, 2006. CB, IG

Simina Cornelia CONSTANTINESCU, "Caractérisation d'un profil protéique à partir des bactéries du sol par la méthode d'électrophorèse bidimensionnelle", Rapport Bibliographique, Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque Esitpa, 2006.AH, IG

Laure DECHAUX, "Les PLFA, un indicateur de la biomasse fongique", Rapport Bibliographique, Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier, Bibliothèque Esitpa, 2006. CB, MLG

Laure DECHAUX, "L'ergostérol, un indicateur de la biomasse fongique - Etude de l'impact de polluants sur la biomasse fongique dans les sols agricoles. Extraction et quantification de l'ergostérol", Rapport Stage de fin d'Etudes, Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier, Bibliothèque Esitpa, 2006. CB, MLG

Nadine TADJA NYA, "Le Compartiment fongique des sols: Analyse de l'impact de Cuivre sur la biomasse fongique et développement d'une procédure bioinformatique de génération d'amorces de PCR génériques", Rapport Master 1 "Biologie cellulaire et physiologie" - Spécialité "BioInformatique", Université de Rouen, Bibliothèque Esitpa, 2006. CG

Sophie DUVIALARD, "Estimation de la Biomasse Fongique des sols agricoles par quantification de PLFA spécifiques en chromatographie phase gazeuse", Rapport Licence de Chimie, Université de Rouen, Bibliothèque Esitpa, 2006. CB, MLG

Laetitia FOURRIE, Claude AUBERT, Sylvie BARRAY, Christian BEAUFRETON, Jean-Marie BODET, Raphael CALBRIX, Michel CARIOLLE, Anne-Claire LATRILLE, Karine LAVAL, "Modalités agronomiques et effets environnementaux d'épandages de produits organiques en Pleine de Caen. Optimisation d'épandages de produits organiques en agriculture et effet sur certaines activités biologiques des sols", Rapport final, ACTA, Décembre 2005. (Financement: ADEME, Agence de l'eau Seine Normandie, Conseil Général du Calvados, Conseil Régional Basse-Normandie), Bibliothèque Esitpa, 2005.

Raphael CALBRIX, "Impact des intrants organiques sur la diversité des bactéries telluriques dans les sols agricoles", Thèse de Doctorat, Universitté de ROUEN, 15 Novembre 2005. (Jury: Pres.: Prof. N. Orange - Rapp.: Prof. C. Chenu, Dr. X. Leroux - Exam.: F. David - Dir.: Prof. S. BARAY, Dr. K. Laval), Bibliothèque Esitpa, 2005. SD, KL, SB

Camille DEREAVE, "Effect de l'implantation à long terme de cultures intermédiaires pièges à nitrates sur l'activité biologique des sols et la qualité de la matière organique", Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque ESITPA, 2005. CB, IG

Maud MAZE, "Estimation de la Biomasse Fongique des sols agricoles en Chromatographie liquide haute performance par quantification de l’Ergostérol", Rapport Master 2 professionnel "Analyse contrôle et expertise dans l’agrochimie et les bio-industries", Bibliothèque ESITPA, 2005. CB, MLG

Farida LAADANI, "Estimation de la biomasse fongique de sols agricoles par quantification de la PLFA spécifiques en chromatographie phase gazeuse", Rapport Licence chimie analytique démarche qualité , Bibliothèque ESITPA, 2005. CB, MLG

Sylvie DESAIRE, "Quantification des communautés bactériennes telluriques par cytofluorométrie en flux", Rapport Maîtrise Biologie Cellulaire, Université de Rouen, 2005.

Odile LUCAS, "Quantification des bactéries telluriques par cytofluorométrie en flux", Rapport Master professionnel "Génétique, Physiologie, Biotechnologie" Bibliothèque ESITPA, 2005. SD, KL

Amine EL HOCINE ATEK, "Dosage des activités enzymatiques dans le sol", Rapport Master I "de Biologie et application parcours microbiologie recherche", Bibliothèque ESITPA, 2005. CB, IG

Tawfik FAIJRI, "Validation d’une méthode de quantification des communautés bactériennes et fongiques des sols par PCR en temps réel et estimation de leur pouvoir prédictif dans la qualité des sols", Rapport Master Biotechnologie appliquée aux champignons, Bibliothèque ESITPA, 2005. CG

Audrey FAUCON, "Estimation de la qualité des sols agricoles par quantification des mircroorganismes telluriques par PCR en temps réel – Etablissements de valeurs seuils", Rapport Master 2 Mention Biologie Fondamentale et Appliquée ECOCAEN "Gestion et valorisation agri-environnementales", Bibliothèque ESITPA, 2005. CG

Gaëtan MONNIER, "Mise au point méthodologique et évaluation d’un protocole d’électrophorèse bidimensionnelle des protéines du sol", Rapport Maîtrise de Biologie , réalisation et analyse de profils protéiques des sols, Bibliothèque ESITPA, 2005. CB, IG

Quentin BURY, "Spéciation des éléments-traces en sols contaminés, distribution et phytodisponibilité vers les cultures de lin oléagineux", Rapport DESS Valorisation Chimique et Biologique des Productions Agricoles et Forestières, Bibliothèque Esitpa, 2004. MLG

MélanieTOUTAIN, "La PCR en temps réel, un nouvel outil d’évaluation de la biomasse microbienne tellurique", Rapport Maîtrise de Biologie des Populations et des écosystèmes, Bibliothèque ESITPA, 2004. SD, KL

Céline DUQUE, "Corrélation entre le potentiel infectieux d’un sol mesuré par le test Biologique et la quantité d’Aphanomycès euteiches détectée par PCR en temps réel", Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque Esitpa, 2004. SD, KL

Soïzic QUIMERC’H, "Etude de la diversité des communautés fongique telluriques dans des parcelles de pois protéagineux française contaminées par Aphanomycès euteiches", Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque Esitpa, 2004. SD, KL

Samuel SARCIAUX, "Effet des cultures intermédiaires pièges à nitrates sur la diversité microbienne des sols de champagne crayeuse", Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque Esitpa, 2004. IG

Nicolas RICHARD, "Clonage d’un fragment d’ADN génomique d’Aphanomycès euteiches pour l’élaboration d’un étalon de quantification", Rapport SIR Esitpa, Bibliothèque Esitpa, 2004. SD, KL

Karima CHEKOUR, "Biomasse fongique dans les sols. Techniques d’extraction et quantification de l’ergostérol par HPLC", Rapport Maîtrise de Biologie des Populations et des écosystèmes (option : Environnement), Bibliothèque ESITPA, 2004. MLG

Sophie CORNU, Blandine CLOZEL, Jérôme ROSE, Sylvie DESAIRE, Karine LAVAL, Isabelle COUSIN, Valérie DESCHATRETTES, Laurent VINCENT, Mohammed BOUSSAFIR, Céline LARRECHE, "Influence de la structure du sol sur la distribution des éléments traces et des micro-organismes dans les sols. Conséquences environnementales", Rapport Fianl, Programme National Sols et Erosion - ACI Ecologie quantitative, INRA Orléans, Février 2004.

Jimena RIPA MIGUELEZ, "Analyse de la répercussion de différents épandages sur la diversité des communautés microbiennes telluriques", Rapport Stage Fin d'Etude ISARA de Lyon, Bibliothèque ESITPA, 2003. RC, SD, KL

Helena MARQUES, "Mise au point de la quantification par PCR en temps réel des communautés fongiques du sols dans le cas de systèmes agraires contrastés", Rapport Stage Fin d'Etude ISARA de Lyon, Bibliothèque ESITPA, 2003. CG

Sophie MAYER, "Mise au point de la quantification par PCR en temps réel de micro-organismes phyto-pathogènes de la pomme de terre. Détermination des seuils de microorganismes responsables des symptômes ", Rapport SIR ESITPA, Bibliothèque ESITPA, 2003. SD, KL

Bertrand BOUTROUX, "Transfert des métaux lourds du sol vers la plante. Leur disponibilité pour le lin oléagineux", Rapport DESS analyse, Contrôle & expertise dans les bio-industries et l'agrochimie, Bibliothèque ESITPA, 2003. CB, MLG

Benoit MARTINET, "Etude de la biomasse fongique dans différents types de sol. Extraction et analyse par Chromatographie Liquide à Haute Performance de l'ergostérol", Rapport Maîtrise de biologie de populations et des ecosystèmes, Bibliothèque ESITPA, 2003. CB, MLG

Audrey PETIT, "Mise au point de la méthode de dosage de l'ergostérol dans le cadre de la détermination de la biomasse fongique par CLHP", Rapport BTS Biochimie, Bibliothèque ESITPA, 2003. CB, MLG

Amélie MAERTENS, "Mise au point d’une méthode de dosage de huit monomères de sucres par HPLC ", Rapport DUT Mesures Physiques, Bibliothèque ESITPA, 2003. CB, IG

Pierre PLASSART, "Etude de la diversité des communautés microbiennes telluriques dans différents systèmes agraires contrastés ", Rapport Maîtrise de biologie cellulaire et physiologie végétale, Bibliothèque ESITPA, 2003. SD, KL

Florence TRUYENS, "Effet des cultures intermédiaires pièges à nitrates sur l’activité biologique et sur la qualité de la matière organique des sols crayeux de Châlons-en-Champagne", Rapport Maîtrise de biologie de populations et des ecosystèmes, Bibliothèque ESITPA, 2003. CB, IG

Christophe VATTEMENT, "Etude des communautés bactériennes telluriques par l'outil moléculaire", Rapport Maîtrise de biochimie cellulaire et moléculaire, Bibliothèque ESITPA, 2002. SD, KL

Emilie AUBERT, "Etude des communautés microbiennes des sols dans des systèmes agraires contrastés", Rapport Maîtrise de biologie cellulaire et physiologie végétale, Bibliothèque ESITPA, 2002. SD, KL

Fatima KHARBOUCH, "Etude des teneurs en éléments traces dans des sols après épandage de boues urbaines et irrigation par les eaux usées et leur devenir dans le lin", Rapport Maîtrise de biologie cellulaire et physiologie végétale, Bibliothèque ESITPA, 2002. MLG

Matthieu WATEAU, "Mise en place de différentes méthodes d'extraction du phosphore des sols des zones humides de la vallée de la Seine", Rapport Maîtrise de biologie de populations et des ecosystèmes, Bibliothèque ESITPA, 2001. SD, KL

Sylvia ZEBROWSKA, "Variabilité spatiale de la biodiversité d'un sol de prairie: mise en relation avec la diversité floristique du compartiment épigé", Rapport Stage de fin d'étude - Ingénieur ESITPA , Bibliothèque ESITPA, 2001. SD, KL

Pierre PETRIOL, "Dosage d'ETM dans les sols agricoles par absorption atomique - Etude des limites de sensibilité d'un spectrophotomètre", Rapport DUT Mesure Physique, Bibliothèque ESITPA, 2001. CB, MLG

Hélène SAUVAGE, "Stock et dynamique des matières organiques des sols dans des systèmes agraires contrastés.", Rapport DESS Environnement, Université Catholique d'Angers, Bibliothèque ESITPA, 2001. PP

Thomas MARCHANDIN, "Contribution à l'étude de la biodiversité bactérienne d'un sol de prairie", Rapport Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie, Bibliothèque ESITPA, 2000. SD, KL

Sabine DESANLIS, "Contribution du sol dans la contamination bactérienne des eaux de ruissellement", Rapport DESS Environnement amenagement agricole et agro-alimentaire, Bibliothèque ESITPA, 2000.

Nathalie LAUNAY, "Contribution à l'étude des communautés bactériennes d'un sol cas d'un sol de prairie", Rapport Maitrise de Biochimie, Bibliothèque ESITPA, 2000.

Livia BALLEY, "Mise au point méthodologique du système BIOLOG (Profil métabolique)", Rapport DUT Génie Biologique, Bibliothèque ESITPA, 2000.

Gaêlle HEMERY, "Contribution à l'étude de la biodiversité bactérienne d'un sol du pays de caux", Rapport Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie, Bibliothèque ESITPA, 1999.

Lalla Sfiya AIT SIDI MOH, "Etude de la biodiversité des eaux de ruissellement et des sediments du bourg dun", Rapport Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie, Bibliothèque ESITPA, 1999.

Armelle DEMARTINECOURT et Arnaud NANTY, "Relations entre la microbiologie et les caractéristiques physico-chimiques de différents types de sols de l'Eure", Rapport Stage Initiation Recherche, Bibliothèque BioSol, Octobre 1999.


Colloques


SEMINAIRE "Rhizosphère" du 1 février 2002 - Laboratoire BioSol - Esitpa - Rouen
Karine LAVAL, Introduction et présentation des activités de BioSol, Diapos.
Maïté VICRE, Les cellules bordantes de la racine d ’Arabidopsis thaliana",CCME UMR 6037, Rouen, Diapos.
Odile BERGE, Présentation du LEMIR, LEMiR - UMR 163 CNRS-CEA, Cadaraches, Diapos.


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Révision : 6 février 2007.
Toutes les pages ont été créés par Marc LEGRAS